La quasi-totalité des généraux d’ascendance Noire/Africaine qui étaient en fonction furent rayés des cadres, à commencer par Toussaint-Louveture. Ce fut également le cas du général Dumas. Deux décrets secrets furent pris le 29 mai 1802, l’un visant les soldats « Noirs/Africains » Et l’autre les soldats de « Couleur (Métis) ».
Dans la même logique, il fallut épurer les écoles d’officiers et en particulier, l’école polytechnique créée le 28 septembre 1794. Plusieurs élèves ayant été signalés comme « Noirs/Africains ou de Couleur (Métis) », furent exclus en mai 1802, malgré les vives protestations de leurs camarades. On retrouvera des situations similaires 140 ans plus tard, sous l’Occupation.